تعتبر الشفافية والحوكمة الرشيدة من أهم المعايير والقيم الموجِّهة لأعمال صفاقس الخيرية ، فمن خلال الوضوح الكاملة في البرامج والأنشطة التي تحكمها الرقابة والشفافية والنزاهة، استطاعت الجمعية كسب ثقة المتبرعين وزيادة الثقة والمصداقية بالعمل الخيري عموما في الجهة .
وتسعى صفاقس الخيرية في توجهاتها الإدارية لتنفيذ خطط ترمي لتعزيز ثقة المتبرعين والداعمين للأعمال الخيرية من خلال تقديم كشف حساب للمتبرع يوضح أوجه صرف المبالغ مع إشراك المتبرعين والداعمين بالاطلاع على كيفية وصول التبرعات والدعم وإشراكهم في البرامج الخيرية من كفالة أيتام ورعاية أسر وغيرها من البرامج ...، كما تسعى الجمعية في استثمار التقنية من خلال إشعار المتبرعين عن أوجه صرف تبرعاتهم الكترونياً أو عبر رسائل الوسائط المتعددة مما يضمن استمرار القائمين عليها في التبرع.